Sīka datu analīze, kas tika iegūti no vairākiem liela mēroga klīniskajiem pētījumiem, izmantojot sēņu polisaharīdus, apstiprina, ka blakusefekti no sēņu preparātiem ir minimāli. Pētījumā, kurā piedalījās 469 pacienti, kas lietoja lentinānu (polisaharīdu ekstrakts no Lentinula edodes, šitake), tikai 32 no tiem minēja blakusefektus, taču neviens no tiem nebija nopietns (ādas apsārtums, spiediens krūtīs, nelabums). Žurnālā "Lancet" publicētie rezultāti šim pētījumam, kas tika veikts ar mērķi noskaidrot PSK (proteoglikānu ekstrakts no Trametes versicolor, raibā tauriņpiepe) ietekmi kuņģa vēža gadījumos, ļāva secināt: "netika novērti nekādi toksiski blakusefekti, rūpīgi pārbaudot visas pacientu anketas".
No sēņu lietošanas vajadzētu izvairīties pacientiem, kam diagnosticēta vai ir aizdomas par alerģiju pret sēnēm.